Budova náchodského nádraží byla postavena v souvislosti s výstavbou choceňsko-broumovské dráhy. Její slavnostní otevření se uskutečnilo 25. července 1875. V roce 1911 začala přestavba, která dala nádražní budově podobu na dalších sto let.
Během té doby se k budově přistavovaly nejrůznější „přílepky“, které sloužily jako hospody, trafiky a jiné obchody. Kvůli tomu působilo celé náchodské nádraží neuceleným a nehezkým dojmem.
Autobusová stání před budovou nezakrývala střecha a celkově byla špatně vyřešená, autobusy musely po nástupu cestujících před odjezdem ze svého stání opět vycouvat.
V roce 2013 se k rekonstrukci nádraží společně rozhodli a zavázali oba majitelé areálu: město Náchod (vlastník autobusového nádraží) a České dráhy (vlastník nádražní budovy).
V první fázi v letech 2013–2014 se odstranily všechny nepůvodní objekty v areálu nádraží a proběhla celková rekonstrukce a reorganizace autobusových stání. Autobusové nádraží dostalo střechu ze vzdušné skleněno-železobetonové konstrukce.
Druhá fáze v letech 2016–2017 zahrnula rekonstrukci nádražní budovy, tedy fasády, interiérů a inženýrských sítí, a obnovou prošlo také přiléhající vlakové nástupiště a jeho zastřešení.
Osvětlený nápis Náchod nenechá nikoho na pochybách, do jaké stanice právě přijel. Cestující si mohou užívat komfortu srovnatelného s nádražími krajských měst včetně světelných tabulí a obrazovek s časy příjezdů a odjezdů spojů.
Veškerá autobusová stání jsou zastřešená, v nádražní budově je kromě moderních toalet a čekárny k dispozici také malá obchodní galerie s prodejnou potravin, pekárnou a pizzerií. K turistickým cílům a institucím ve městě navede návštěvníky přímo od nádraží městský navigační systém.
Železniční stanice Náchod obdržela zvláštní cenu v 11. ročníku soutěže o nejkrásnější nádraží v České republice, a to za celkovou modernizaci, propojení s autobusovým terminálem a za přívětivou péči o cestující. Náchodské nádraží se dočkalo také ocenění generálního ředitele Správy železniční dopravní cesty Pavla Surého.
Zdařilé rekonstrukce jsou aktuálně k vidění na putovní výstavě Má vlast cestami proměn.